Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ABCE1P61221 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms