Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms