Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms