Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP53609 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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