Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms