Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms