Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP153P49790 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms