Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLMP48507 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms