Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms