Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NSG1P42857 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSG1P42857 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms