Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPOP42166 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPOP42166 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms