Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms