Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BMI1P35226 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BMI1P35226 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BMI1P35226 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BMI1P35226 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms