Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-FP30511 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms