Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PEX2P28328 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX2P28328 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms