Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms