Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APEX1P27695 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APEX1P27695 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APEX1P27695 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APEX1P27695 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APEX1P27695 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APEX1P27695 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APEX1P27695 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APEX1P27695 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms