Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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