Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA6P23229 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA6P23229 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms