Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms