Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms