Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCF2P10911 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MCF2P10911 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MCF2P10911 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms