Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHGAP10645 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHGAP10645 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHGAP10645 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHGAP10645 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHGAP10645 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHGAP10645 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHGAP10645 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHGAP10645 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms