Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBSLP0DN79 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBSLP0DN79 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms