Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms