Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms