Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXB5P09067 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXB5P09067 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXB5P09067 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXB5P09067 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB5P09067 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB5P09067 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB5P09067 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB5P09067 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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