Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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