Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APODP05090 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APODP05090 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APODP05090 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APODP05090 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms