Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms