Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL3O95236 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL3O95236 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL3O95236 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL3O95236 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms