Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSVO60911 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSVO60911 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSVO60911 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSVO60911 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms