Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLX3O43711 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLX3O43711 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLX3O43711 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms