Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms