Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1D1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1D1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1D1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1D1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms