Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-2B6SEH9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms