Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DXG7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DXG7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DXG7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms