Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HMGB1P1B2RPK0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms