Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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