Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF22A3QJZ6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms