Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms