Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms