Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP11Q9Y3A2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms