Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIF3AQ9Y2N7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms