Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCE1Q9Y256 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCE1Q9Y256 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms