Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms