Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms