Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms