Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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