Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTSFQ9UBX1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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